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中外文武臣僚恭勸登極，乃於閏六月二十七日即皇帝位於南京。詔曰：『朕以天步多艱，皇家末造，憂勞監國，又閱月於茲矣。天下勤王之師既以漸集，嚮義之心亦以漸起，匡復之謀亦漸有次第。朕方親履行間，鼓舞率勵，以觀厥成。而文武臣僚咸稱萃渙之義，貴於立君。寵綏之方，本乎天作。時哉弗可失，天定靡不勝。朕自顧缺然，未有丕績，以仰對上帝，克慰祖宗。而臨安委轡，尊攘無期，大小汎汎，如河中之水，朕敢不黽勉以副眾志而慰群望？朕稽載籍，漢光武聞子嬰之信，以六月即位鄗南，即以是年為建元元年，誕膺天命。昭烈聞山陽之信，以四月即位漢中，即以是年為章武元年，立宗廟社稷。艱危之中，豈利大寶？亦惟是興義執言，繫我臣庶之望故也。以今揆古，即以是年為元年。其承天翊運定難功臣，悉以次第進爵行賞。分茅胙土，稍俟恢復，以勒勛庸。其翊運宣猷守正文臣，亦以次進級，別需表章。孝秀耆宿，軍民人等俱依前諭優給。行在所山川鬼神除淫祠外，皆遣正官精禋祭告，以示朕纘緒為天下請命之意焉。』以是年爲隆武元年，頒詔於八府一州，有一十八款。時於行在午門外宣讀詔書，臣民跪听者數千人。先是五鼓，聖駕自督府移入布政司，燈燭輝煌，軍容壯麗，各官咸以次入，觀者如堵。平虜鄭芝龍戎裝騎馬，行於駕前，定虜鄭鴻逵率禁軍殿其後，至司，即入行宮，百官鵠立，始聞環珮之聲。寅時，上用衮冕玄服，升殿受朝賀。初行五拜三扣頭禮，繼又行二十四拜焉，亦海濱一曠觀也。
改布政司爲行殿，扁鼓樓門爲行在大明門，諡唐國高曾祖考四代，親上洪號，以按察司爲平夷侯府，都司爲錦衣衛，鹽運司爲通政司，巡撫衙門爲吏部，海道衙門爲戶部，提學道衙門爲都察院，稅課司爲南寮院，餘各官皆租民房受事。一時創制，耳目更新。
改福州府爲天興府，以少卿銜攝知府事。蓋以龍飛首郡，比順天、應天、承天之例，故改爲天興，從吏部主事余颺之請也。
七月初六日，誅清使馬得廠。改天興府學爲國子監。先是辛，颶風壞學宮，郡人馬思理與諸生鄭澤等謀重修，茲始落成，似有待聖天子崇禮先師，爲中興國學，鄭澤等准貢入監，馬思理加陞一級有差。設五城東、南、西、北、中五城巡視御史，兵馬司如之。旌表錢塘縣知縣顧咸建死節。諭司經局正字薛瑞泰，搜訪遺書不論新舊，指點藍硃，至《十六朝實錄》尤爲要典，着爾用心，孤不負此忠欵。勅諭文武臣民曰：『朕今痛念祖陵，痛惜百姓。狂虜汙我宗廟，害我子民，滛掠剃頭，如在水火。朕今誅清使，旌忠臣外，誓擇於八月十八日午時，朕親統御營中軍，平虜侯鄭芝龍御營左先鋒，定虜侯鄭鴻逵統率六師，御駕親征，尚賴文武臣民勇效智力，謀冨才能，回報祖宗，以赦百姓。有功者，朕必厚報，再無食言，特諭！』同日發出安民告示一通，司禮太監龐天壽傳諭：『行在合用物件惟以簡樸爲本，有司官不得違旨阿奉，以害民生。』勅諭行宮中：『不許備辦金銀玉各器皿，止用磁瓦銅錫等件，並不許用錦繡洒綫絨花，帳幔被褥止用平常布帛，件件個從減省，成朕恬澹愛民至意，違者即以不忠不敬治罪。』上長齋布素，日與大臣講求政治於便殿，性喜書籍，搜閱不丙。夜御書自敘云：『朕始祖唐定王高皇帝二十二子，母李賢妃出，洪武二十四年受封，永樂六年之國，傳子靖王，早逝無嗣，弟繼爲憲王。王長子悼簡，世子早薨，次夭，第三子舞陽王襲封爲莊王。王子成王，以穎昌王進封世子，無子，二弟浙陽王亦絕，三弟文城泰靖王長子入繼爲敬王，追封恭靖爲唐王。王繼統三十餘年，壽七十一歲，蒙世廟存問。子順王，順王子端王，端王子迨封裕王，裕王万曆二十二年封世子，長子即朕也。家庭多難，端不悅裕，在內官宅。母毛娘，娘生朕於萬曆三十年四月初五日申時，先有雲神擁送之兆，後有遍身鱗錦之祥。祖不悅，而生祖之母爲曾祖母魏，悅之。八歲延師，僅辨句讀。十二歲曾祖母薨，祖即將朕與父入禁，篝佛燈，日夜苦讀，禁十六年，朕二十八歲，尚未報生焉。崇禎二年二月，父爲叔鴆，朕誓報仇，賴有司之待公，天啟心於祖考，請於烈廟，奉敇准封。本年十二月十二日，祖考亦薨，朕乃奉藩。五年六月初二日受封，九年六月初一日請覲，七月初一日報仇，二十日請勤王，八月初一日起行，十一日見部咨，冦梗回國，十一月二十一日奉降遷之命，責朕以越閱擅斃。十年三月二十二日到鳳陽高牆，五月大病，中宮割股。十二年朱大典請宥。十四年韓贊周請宥。十六年路振飛請宥更切。十七年二月十三日奉旨該部即與議覆，而有三月十九日之事，不及全受先帝之恩矣。痛哉！今朕四十四歲，共分四節，一節二十八歲爲家難，二節自二十八歲十二月至三十五歲爲治國，七年十一月奉譴，三十六歲至四十三歲八月皆高牆囚禁八年事爲三節，四節則上年至今事也。』禮部尚書翰林院李士、黃道周至自衢州，上歡然，即日召對便殿，談恢復事宜。稱旨，譽之曰：『真朕中興名相也！』隨即拜大學士，入閣贊助機務。永定土冦王叔光、王中慶、王鳳耒竊發，時因南京國變，劣生叔光等遂集亡命數千往攻大埔等縣。回屯錦風窯地方，去城三十里而陣。又聞武平失守，勢亦鴟張。知縣徐可久練鄉勇，侯保甲用間設奇，真搗其巢，擒斬二百，餘党解散，叔光僅以身免。汀州大旱，斗米三錢。敕下閣部大臣及府州縣各官屬：『凡有清字，俱去其點，㮣用青字。』以清國號大清，上不特惡其人，亦且不欲見其字，雪恥復仇之意，於茲可見。广東大埔縣流賊萬人，攻圍永定縣七日，以知縣徐可久有備，乃引去。敕禁各關兵將，毋得放逆輔馬士英入關。士英在金陵賣官納賄，顛倒賢奸，三尺童子咸唾罵。清至金陵，奉聖安駕同行，勢逼不能顧，棄之。又奉慈禧太后至杭，杭人不相容，勢逼又棄去。獨擁輜重，與部下將士數千奔逃各處。方國安、朱大典咸數其悮國之罪而朝逐之。聞今上即位閱海，又謀入關，平虜侯鄭之龍素與士英善，以其不即降清而亟亟求太祖子孫而立之，一念可嘉。上下其議於廟堂，議云：『士英蠹國僨師，禍延宗社，擅權納賄，怨結生靈，養私兵以致冦，爲兇暴於國門，擁天子以出居，遂賣君於中道，繇旨言之，悮我聖安皇帝，悮我慈禧太后。蒙𠪨播遷，罪在天下，當爲天下之所共誅！繇今言之，不奉隆武之朔，不請藳街之辜，矯虔狼戾，罪在本朝，當爲本朝之所共討！今江右有馬兵象兵，皆云滇南遺孽；湖東有惠登相、金聲桓，亦舊與奸輔闇通，士莫若能圍功自贖。以黔人收滇兵，爲功甚易，以馬兵收象賊兵，奏傚非難。倘有桑榆之勳，略見街橛之路，亦諸臣所以曲棒天心，弘聞法綱者也。』上以爲然，故行文於各閣，凜奉確遵。
以李世奇爲左春坊左庶子，王賴垓爲右春坊右庶子，俱兼翰林院侍讀。
十二日，召對永勝伯鄭彩於便殿。以唐王某爲監國，鄧王某爲協守，改都察院爲唐王府，竂院爲鄧王府。命工部造御前令箭三十枝，備親征用。親征駕出芋江，以父老遺道懇留，不得已復還朝。議者咸謂國家之失，在此一着，蓋江浙二省抑望王師，急如極溺救焚。出閧一日則人心一日九觧，惜哉！特設儲賢館，以蘇𫝎生爲翰林院學士，耑理其事。皇上求賢若渴之念始見於此。雖館中考課無虛日，而碔砆似玉、魚目混珠，所收者多芊質虎皮，可慨也！殺貪酷浦城知縣施壉。以副總兵施福守崇安閣。
十九日，廣冠攻破武平。時城內西街猶在演戲，有奸巡打口號三聲，賊遂攻入，百姓自相殘踏而死者不計其數。江西廣信府永豐縣原任大理寺左少卿詹兆恆、上饒縣原任廣西南寧府知府楊開中上賀表推戴𣳮，旨答之。
二十二日，以大學士黃道周聯絡江西，救徽援衢
弘光元年六月，靖虜伯鄭鴻逵、禮部尚書黃道周等，擬奉唐藩監國於閩省。十七日至衢州，六師聚會，王乃秉鉞徇師而誓曰：『嗟爾有眾，咸聽予言：昔有胡元，腥穢宇宙，汨爾黎民，以為被髮左衽；黎民哀痛，無有甘食。天乃命我太祖高皇帝驅而出之，還於朔漠；天下欣戴，如出昏窖而睹日月。於今二百七十八年，帝十七葉，未有失德。而寇賊乘釁，覆我二京；將復汨我黎民，以為被髮左衽。幽明人鬼，咸用痛心。予自早歲懲毖是患，不憚危苦，以攖茲咎；而天未厭亂，不達鄙懷。今兩京遞覆，蠢爾又至；臨安監國不競，士民瞻烏。予念崇禎在御十有七年，勵精圖治，惟是舉錯拂於民心，賞不當功、罰不當罪，懲勸無章，以至今日。今諸夫子、君子閔念黎元，欲為立主，不以予不肖，俾統六師，監此函夏。亦惟是賞罰勸懲，實用有章，功不可以倖取、罪不可以倖卸；袞鉞之用，兆始於今。爾夫子、君子各率多士，廣乃德心，其尚桓桓，如熊如羆，恭行天討，以光復帝室，驅逐清兵，以纘我太祖之業。其有摧堅陷陣，拘執醜眾，獻力自著者，皆不惜茅土，弈世帶礪，盟之河山。其有私作寇攘，踰垣牆，誘臣妾，逸馬牛風，俱有常刑。其夫子、君子或不念上帝及我太祖，虞貳爾心，私即淫，自營威福，暗干名器者，天地鬼神亦共殛之。自今以始，同力一心，以匡帝室。勗哉多士，咸聽予言』！
又百官恭請監國，諭曰：「孤聞漢家再墜，大統猶繫人心；唐室三喪，長安不改舊物。豈獨其風俗醇固，不忘累世之澤哉？亦其忠義感憤，豪傑相激勸，使之然也。孤少遭多難，勉事詩書；長痛妖氛，遂親戎旅。亦以我太祖驅除胡元，功百世，方十七葉而虜彝驁然，睥睨神器；為子孫者誠不忍守文自命，坐視其陵遲。二十年以來，賊寇洊驚，孤未嘗兼味而食、重席而處。比方二載，兩京繼陷，天下藩服委身奔竄。孤中夜臥起，涕泗縱橫。誠得少康一旅之師、周平晉鄭之助，躬率天下，以受彤弓，豈憂板蕩哉？今幸南安、靖虜兩大將軍志切匡復，共賦舞衣，一二文臣，以舂陵、瑯琊之義，過相推戴，登壇讀誓，感動路人。嗚呼！昔光武、玄德皆起於布衣，所遭絕續，與大敵為仇，而能正名舉義，躬承大統。況今神器乍傾，天命未改，孤以藩服感憤間關，逢諸豪傑，應即投袂，知明明赫赫之際，神人謨，上天所眷顧，我太祖祐其子孫，猶未有艾也。書曰：「與治同道者罔不興」。傳曰：「得道者多助」。自今孤總六師，一切民間利病，許賢達條陳；孤將悉與維新，總其道揆，副海內喁喁之意焉』。
二十日，唐藩過仙霞嶺，祭告漁梁鎮神。其文曰：『維我太祖高皇帝實起南服，廓清宇內。爾山川靈爽，亦率厥職，無有沴厲，以迄於今。邇以賊寇陸梁，覆我二京，中原腥穢，未能自沷。太祖震怒在天，將率海道百神，以開雲雷之屯，實誘予心，踰茲嶺嶠。嗟乎！以爾神靈雄偉聰睿甲於天下，生為俊傑，子雨友風、伯虎仲熊，以驅逐胡馬，靖彼犬羊，猶掇之也。予昭大義，監國於斯；將藉神靈，以匡天下。敢用玄牡，昭告所在山川，亦念曾孫間關號召，不遑啟處。惟上帝眷顧及我皇祖，是庇是輔，是報是享。勿以一隅自狃，而貳爾心。有道曾孫某某謹告』。
二十三日，唐藩至浦城縣。祖制：親藩不得擅自起兵。唐藩以父為叔鴆，襲封後，即舉兵報仇勤王；啟行，以寇梗還國。崇禎九年，奉遷降之命，以越關擅斃送高牆。甲申三月十九日，北京闖賊之變，烈廟身殉。五月十五日，福藩即位金陵，詔改來年為弘光元年；隨允廣昌伯劉良佐奏，赦原爵唐王奉降庶人御諱聿鍵於鳳陽高牆。十二月，賜復親王冠帶，送東粵閒住。貧無路費，自鳳陽至南都，遷延時日，又回鎮江，由丹陽至蘇州。風聞清兵陷南京，天子蒙塵，乃避難至湖州，又至嘉興。大總兵陳洪範、陳梧、汪碩德、吏部尚書徐石麒、淮撫錢繼登、太監高起潛等面請唐藩監國，堅辭謙讓。乃睿撰揭帖，倡奉潞藩。又得慈禧太后之命，潞藩隨於六月初八日監國於杭州。初十日，唐藩至杭請朝，具本勸進，面陳方略，不允。靖虜伯鄭鴻逵面請回閩取兵，亦不允。是晚，清牌至杭州，潞王從閹弁之議，甘心降清。唐藩聞而憤泣不勝。適遇靖虜伯會同禮部尚書黃道周等奏啟懇請監國。十五日，清騎至杭，浙東人心震動，唐藩不得已，始勉從之。六月二十三日進關，抵浦城縣。
按黃道周第一疏有云：『天造不寧，道先立主；昌期協應，臣亦擇君。兩載而陷二京，河山雪涕；敷天而污左，人鬼恫心。非有不世出之英，莫勝大有為之任。恭遇唐王殿下，偉略著於維城，玄風聞於主鬯。太祖廓清六合，有天下者還屬太祖之孫；漢家再造神州，起南陽者即復漢家之業。昔當寇迫都城，殿下已請師投袂；況今禍連江，蒼生又仰屋瞻烏？荏苒則人化沙蟲，棲遲則家成荊棘。瑯琊先討石勒，後渡五馬之江；宛葉初會平林，遂發昆陽之績。以今揆古，易世同符。語德則德於瑯琊，語親則親於宛葉。所謂合晉元、光武以成殿下之身，藉猛士、謀臣以纘高皇之緒者也。矧殿下社稷為心，祖宗是念。高皇之子二十人，惟王逾於重耳；唐室之君十七葉，立國何必沙陀？伏乞俯循眾望，監統六師；使黎庶有歸，皇圖克鞏」云云。六月十一日疏上，答云：「覽啟悲慟，義不忍聞。孤藩開自高廟，十代世篤忠貞；孤罹家庭偶異，曾叨先帝殊恩。因奮血性，期圖報不負君親；敦請勤王，討父仇為法受過。上年弘光皇上憫鑒，復賜王冠。孤受二帝深恩，誓竭迎鑾雪恥；但愧微渺，徒耿赤誠。春秋之義意：天子蒙塵，諸侯釋位；孤惟遵此成規，賢序實無一稱。監國之請，面諭周詳，感諸先生忠愛孤身，斷不敢當。共體守節真懷，不必再有陳請』。第二疏云：『日月重光，四海切黃衣之望；乾坤再闢，萬方仰白水之祥。五百年必有王興，適逢今日；十八傳宜歸哲后，當屬仁賢。宗社憑依，臣民引領。恭維殿下欽明天縱，玄德日升。險阻備嘗，晉公子之播遷，良有以也；閭閻親歷，史皇孫之艱難，豈徒然哉？茲者金甌震缺，翠輦蒙塵；南轅之返無期，左之氛正熾。國不可一日無主，主不可一日非人。惟德惟賢，乃肩乃荷。克承臣仕，親在君王。拒群工之敦請，令諭雖極沖虛；救萬姓之倒懸，監國終難他奉。伏乞仰思祖宗垂創之統、下念蒼黔推戴之誠，早膺負扆之朝，以肅王綱之度；使吏士有所維屬，人心不至渙離。張我六師，掃清彝寇；躬行九伐，克復神京。天下幸甚！臣民幸甚』！六月十二日疏上，答云：『皇上多日出狩，臣庶迫切無君，封疆日促、狂彝日逼，監國攝政，固不可遲。但孤靜淡自天，口虛非當；前諭甚明，豈飾觀聽？昨感所啟，業已具揭，但奉潞藩監國矣。彼則以賢以序，真其人也。孤願與諸先生共行推戴，以折彝謀，他啟斷不敢再聞』。第三疏云：『國步多艱，王室已深於板蕩；天心厭亂，人情咸屬於仁賢。兵燹之毒方殷，共球之思愈迫。恭維唐王殿下，聰明亶作，慈孝夙成。枕戈以請勤王，久樹桓文之業；瀝血而謝君父，獨通姚媯之權。恭儉溫文，廓爾寬仁之度；聖神文武，翕然海宇之歸。近聞清逼武林，人無固志；賊臣有屈膝之議，舉國同蒙面之羞。思高皇創業之艱，退一尺則失一尺；為中興恢復之計，早一時即易一時。幸切宗社之圖，勿固士大夫之節。神器不可以久曠，令旨不可以時稽。亟總瑤樞，以臨魁柄。將義師有主，昆陽成長者之功；醜虜望風，靈武睹聖人之烈』云云。六月十五日疏上，時潞藩已具降書矣。令旨答云：『覽啟，諸先生懃懃懇懇，謂皇鑾既時不易返、潞藩復懼清改圖，以孤勤皇雪父，大義久昭；況分國本於高皇，視孝陵情尤關切。監國必難他諉，三請辭意益殷；令孤進退均難，孤將何以處此？且今人心口彝，內外沸鼎，交請敢再堅違？孤罪滋重，萬不得已，將所上監國之寶，權置行舟，即諭地方官速遣專官謹守。然於出令用人，在途猶難草草；俟至閩省，面與藩鎮文武諸賢共行遵守』云云。二十四日，令旨：『諭浦城縣：將孤發下旌直銀五兩，賜欽命禁旅勇衛水師總兵陳有功』。復諭之曰：『孤覽爾啟，為之慨憤。自允監國之後，若一日孝陵未見，一日西北赤子未援，一統舊疆未復，即是孤負祖負民，如劍在心、如湯沃背，斷不與寇盜並立於天壤。該將啟內勸孤節儉愛民，足徵忠讜。孤鑒千古：凡真忠臣，必明指君之過舉，改正君身，天下自定。凡不言孤過者，即偽忠也。孤纔至閩，見此啟本，即是中興名疏。著發此啟於靖虜伯大張榜示，見孤汲汲求賢、願拜昌言至意』。浦城縣知縣鄭為虹進大明會典一部、縣志一部；典史陳國元進方孝孺文集一部。二十五日，令浦城縣命工刻石置公署門外，上書『敬奉監國令諭：本縣印佐迎送上司，止於郭外。敢有再行違諭迎送者，察出一體從重治罪；法在必行，決不輕貸』！蓋從典史陳國元之請也。從諫如流之意，於此可見矣。書坊送綱鑑一部、續稗海一部、浙江通志一部，給價銀四兩三錢還之。二十六日，朝見人民於建安，監國令諭曰：『昔我太祖高皇帝掃蕩胡氛，統一區宇；成祖文皇帝燕都定鼎，威震華彝。仁涵義育，累洽重熙。何期數當陽九，天降鞠凶！昔年薊北，獨深蒙難之悲；此日金陵，復有北轅之恨。孤慚涼德，雪恥未遑、念切同仇，請纓有志。今爾臣民連箋勸進，至再至三，謂「清迫杭城，人無固志；賊臣有屈膝之議，舉國同蒙面之羞」。孤覽斯言，撫膺隕涕；痛統緒之幾墜，悵天下之無君。不獲已俯順輿情，允從監國。謹於弘光元年六月二十八日朝見臣民於建安，收拾餘燼，恢復南都；張皇六師，迎還玉輅：萃皇靈於渙散之後，出百姓於湯火之餘』云云。
令諭靖虜伯鄭鴻逵出榜安民於八郡一州，曰：『寡人布素一年，毫無煩擾；除下程小飯該縣官備辦外，一切支應併一切氈綵無益等事，俱各免行。當百姓剝骨見骸之時，寡人誓約己以安天下；違旨者，治以不忠擾之罪。隨侍官校不過十人，務要公買、公賣，敢擅取民間根薪、粒米，即時察啟請究，定然綑打八十，割耳游示，決不輕饒。寡人上下費用，件件自備。生平直性實心，字字真誠。爾官一體遵依，毋負寡人拳拳至意』！
太子太保禮部尚書翰林院學士黃道周進誓師文、監國諭、祭告文、登極詔共四通，並繳賜勞銀三兩。手詔答云：『所進撰文，俱能寫孤意中事，且典核有體，孤心嘉悅，留至日備用。孤今晝夜焦勞，新創諸事，萬盼先生速至，便議戡定戰守並監國禮儀，不可刻緩。至在途之費，上下所共需也；同艱分濟，人主之本心，典非溢格，不准再辭。著即祗受，稱孤恤軫至意』。
令諭靖虜伯鄭鴻逵給守關兵餉二月。諭文曰：『昨據先生啟請關防與中標黃將官領兵二千名，令把守仙霞嶺等關；業即俞允，兼令發犒矣。孤發旨後，思念兵將跋涉之苦，孤因親睹；今使兵將把關，必要先足其月餉，然後可責其成功。茲諭先生：各兵將一概應支糧餉，除前欠糧未支併先生賠捐己資代給者，併通算為欠數。俟孤到省，陸續照補外，今將現今把關將兵二千名，即將浦城縣現存正項銀兩，每先給與現今六月一月，並再預支閏六月一月，示孤軫念兵將真誠至意。其額兵二千，傳諭該將一不許兵冒領、二不許縱兵淫酗賭博等弊，抖擻精神、一意防守外，仰先生即將標下大小將領年貌、籍貫、履歷，速造簡明文冊一本，並歷來各將照級支餉數目、各兵行坐每名支餉數目，並今自某月欠起，自今弘光元年正月起至六月止各餉支過幾月？通共領銀數若干？現欠幾月？每月欠銀若干？通共支餉若干？先生賠給若干？曾那應補公家別項若干？某餉斷宜急補、某宜稍緩補給，俱一一速造簡明文冊一本，共冊二本，一、二日內即造進來。其發過犒銀並支過該縣兩月餉銀，散完之後，再行造冊。一面具啟、一面移部，以憑開銷。孤以困頓之餘，宮生內長，從不諳習軍旅併軍國大事，惟先生極力輔孤不逮，以全奉孤南來忠精大節之意』云。
福寧州小民罷市激變。時聞閩廣軍門劉若金欲駐札福寧以抽洋稅，通州士民舖戶粘貼不容進城，恐生騷擾。
二十九日，欽命鎮守福建總兵官南安伯鄭芝龍進冰紗十疋、漳紗五疋、葛布五疋、永春布五疋、軟紗五疋；啟曰：『芝龍盥手跪誦唐王殿下賜諭，如絲如綸，感高厚之恩。惟是天步艱難，並望蕩平之日，幸殿下神聖，尤為中興之主。芝龍前得胞弟鴻逵手信，慎重之過，恐武備未周，致有窺伺，故意從迂遠之行。茲奉令旨諭示，芝龍即會撫按司道及縉紳孝廉貢監生員，無不歡欣鼓舞，共慶昇平。人心如此，天意可知。禍亂之作，皇天之所以開聖人也，其在斯乎！然眾議亦云，只先監國而後登極，此與芝龍之愚見暗合矣。又據差官鄒泰傳諭，欲居貢院。察貢院係山腋，稍雨即有水，當以布政司為行殿。若布政司一時未便搬移，芝龍總兵衙門亦可駐蹕；即與撫按各官議妥，不敢有煩睿慮。其諭旨賜芝龍胞弟芝豹者，因芝龍在省督船、彼在安平練兵，相去六日路程，方差人齎去，未及取啟回報，統惟慈宥。芝龍一味拙直，心口如一；苟有率誤，更望天涵到底，方信芝龍之無他腸也』云云。手詔答云：『自古英雄相遇，凡功業之鉅細，正在相信之淺深。啟內一切慎舉動，擇行在，識慮周詳，任事堅決，孤更感激。另啟所進衣著二十疋，孤即受用，以昭與卿一體之忠愛云爾』。
南安伯鄭芝龍上箋勸駕監國，恢復中興。上答云：『漢唐中興，各有成資。今僅一隅，勢非昔比。況孤庸質，恐羞祖烈。惟是先生兄敬弟忠，勳猷咸著。前靖虜伯奉孤南來，實惟先生是是倚。自孤勉允監國之後，專望先生兄弟盡忠，在朝則孤之心腹也、在邊則孤之左右臂膊也。前託總督守巡之任，孤倡血誠掃彝，再復兩京，孤占先生等才，不愧太祖臣子。至於諸將，則均有安危之寄。一統告廟，功成封侯；孤必不負』。
又諭南安伯鄭芝龍云：『把守關隘一切急務，先生業預料理有緒，孤不勝喜慰。措餉之難，其來已久。孤今惟實至儉至勞，布素外朝，以先天下。餘俟監國之後，與先生等面議而行。至委先生兄弟守巡總督重任，出孤獨斷倚任之專，先生不可辭此官，即孤不可辭監國，萬勿再辭。今孤傍徨無倚，切囑至諭，曲體孤心。孤業於閩省監國，閏六月初一日已過建寧。一切監國事宜，俱要備於擇吉之前。實期明祀再續，臣民復睹漢官。一統所基，關係甚重。勉之！慎之』！
閏六月初二日，福建布、按、都三司、左布政司周汝璣、參議傅雲龍、張文輝、副使僉事柴世珽、陸懷玉、李長倩、羅萬爵、張夬、劉柱國、張晉徵、王芋、都司陳績、郭軻、楊陞誠具箋迎賀，有云：『分珪錫寵，宗支首重於維城；嘉紐儲祥，嗣服莫先於監國。殷憂啟聖，式聆基命之歌；多難興邦，載輯景山之頌。誼既班於臣子，念敢厚於君親。凡底雲天，共增慶慰。恭維殿下忠懷帝室，孝篤天經。國號從唐，治化順堯天之則；藩封移秀，派演流滑水之芳。錫玉輅以榮，執桐圭而作寶；豈謂遭家不造，俾國多艱！念主上之播遷，敷天疾首；痛臣民之流散，率土寒心。苟非白馬之盟，孰繫紫宸之重？爰揆神異，允禎符。是用師錫僉同，天人交與。金枝千葉，獨惟一本之向陽；玉水萬流，共仰朝宗之入海。閩封雖褊，負水憑山；閩眾雖孱，本忠依孝。一成一旅，少康王自有仍；三讓三推，孝文來於代邸。情克勵於膽嘗薪臥，勢務充於泉達火然。保四海而非難，王天下其再見。汝璣等涕淚餘生，遭逢盛舉；悲已深於集蓼，喜忽動於開熙。朝上國之麟圖，翳僅有光赤社；歌高皇之龍種，行將繼美朱陵。伏願持危以慮，雪恥無忘；世德作求，永懷安輯。一新君臣上下之往轍，嘗思光武中興；亟向東西南北之人心，必奏昆陽大捷。想片時胡運，不過腐鼠孤雛；計一統皇輿，佇慶遊麟巢鳳』云云。答云：『孤允藩院公啟，定於本月初七日駕臨布政司監國矣。切望文武協恭，各捐，共圖恢復，仰慰高廟。彝典酬功，孤必不靳』。
初三日，御舟次水口驛。驛乃古田縣地，為入省之咽喉。先是，驛遞具有坐駕大船，祗候延建水次。上卻不用，惟乘民間所用之船僅載數人者，宮眷咸隨在焉；不張綵幔，不設鼓吹。岸旁觀者，皆舉手加額，以為聖德之儉素如此，則一意休養，吾民其有瘳乎！
太子太師南安伯鄭芝龍迎上於舟次，賜接見。傳諭各官，俱候登驛朝參。
上登驛，召見在任、在籍臣二十人，賜坐、賜茶。時駕臨該驛，各官恭迎道左。至驛階下，行四拜禮。唐藩謙抑，賜答兩拜。傳諭各官暫退，仍御標二十員名進。在東者：南安伯臣鄭芝龍、靖虜伯臣鄭鴻逵、巡撫都察院僉都御史臣張肯堂、閩廣督撫臣劉若金、巡按監察御史臣吳春枝、屯鹽道臣羅萬爵、福兵備道臣張夬、分巡道臣王芋、都司僉書臣陳纘、臣王承恩；在西者：戶部侍郎臣何楷、大理寺卿臣鄭瑄、通政司左通政臣馬思理、光祿寺少卿臣林銘鼎、尚寶司少卿臣鄭昆貞、四川按察司按察使臣曹學佺、科臣陳燕翼、臣張利民、道臣郭貞一、黃錫袞。時鄭瑄、馬思理、曹學佺俱在籍，穿吉服；何楷等俱自南京來，穿素服待罪。皇上寬仁，憐其不得已之故，有旨勿問，且欲亟用之云。
面諭：『省城行在，聞擇在布政司；但一時官吏搬移並修理未能猝辦，暫於總兵府駐蹕。各宜仍舊，勿得營造，致滋勞費』。隨諭跟役捧出御用剩銀一百五十兩係淮揚巡撫呈送，除在途犒賞買辦外，即充修葺丹堊之施，勿取諸民間可也。
時有議派修理王宮大縣銀四百兩、小縣銀三百兩者。曹學佺對南安伯鄭芝龍言：「仁聲仁聞，王政之先；豈有睿駕未臨，而先派多金修理？是播侈風於下里也。不肖有司，藉此而括庫藏、科百姓，增美之謂何？而彰其過乎」？芝龍以為然，給示禁止之。
首以何楷為戶部尚書。同日奉令諭：『守關進取，決不可無兵；有兵，決不可無餉。餉出之民，有民而後有餉；安民以裕餉，必須戶部尚書得人。茲眾卿在廷，即僉擇其可者』。於是咸舉臣楷。楷力辭曰：『臣尚負罪，俟明法誅戮，奚敢肩此重任』？叩頭懇避賢者』。皇上以舉出諸公，俯答其拜，而堅欲用之。又曰：『吏部、都察院堂上官、吏科都給事中、河南道等官俱屬要緊，可即推之』。上諭吏部曰：『天步方艱，餉為兵命。戶部重任，得人甚難。茲特面允在籍文武，公舉戶部左侍郎楷，廉而能計，鉅以識微。孤於崇禎乙亥親閱邸報，亦服其侃侃掖垣。危難仗義之人，必於直言敢諫中求之，古人成說，孤奉為範。攝署既不可責成，今又時刻難待，不可拘定。俟於監國之後，何楷陞戶部尚書，即日到任理事，不可刻緩。慎勿再辭，致耽急務。該部即會同何尚書確議擇推，先設福建清史司郎中一員，以便呈堂行事；餘俟再議。併該部即推攝文選司郎中一員。此吏、戶兩司印，速鑄。戶部堂上官印，尤為緊要』。
命巡撫都御史張肯堂速鑄大小衙門印文，俱以「行在」二字置上。
以浦城訓導王兆熊為翰林院待詔，專理睿覽書籍事務。兆熊字念葛，福寧州人，歲貢，任浦城訓導。聖駕入關，即為扈從，後出使溫、台。上稱其『真忠如金石，真清如冰玉』云。
是晚，上命於水口驛下關泰山廟議推各要緊衙門職員，亦有未及聞而不與者。次早，至芋原驛始定，具疏以聞。
初四日午時，御舟次洪塘，登岸，擇吉入城。監國乃暫憩民家，庭無鋪設，市不易肆，人皆以為天子來、更靜於縣官云。
戌時，奉令旨云：『孤今監國閩省，遵照祖制，舉用閣部等官，虛心聽納，惟慎惟公。除不忠先帝皇上、負國害民者概不敢用外，藩院諸衙門既會議確當，即允所啟，分別攝事還職。何楷先資陞授，另有旨了。計開：內閣舊何吾騶、蔣德璟、黃景昉；新黃道周、朱繼祚、丁魁楚。戶部尚書何楷，掌禮部右侍郎劉若金，兵部右侍郎張肯堂、李永茂，協理戎政右侍郎陳洪謐、盧若騰，刑部左侍郎鄭瑄、曾櫻，工部右侍郎周汝璣，都察院左副都御史掌院事張肯堂、徐世蔭，太常寺少卿掌河南道御史吳春枝，浙江道御史黃錫袞，雲南道御史郭貞一，通政司通政使馬思理、陸懷玉，吏科都給事中陳燕翼，兵科右給事中張利民，太常寺少卿曹學佺，光祿寺卿林銘鼎，欽天監博士謝堅、黃漢白、吳太音，鴻臚寺序班楊廷瑞』。
初五日，敕司禮監傳諭：天氣炎暑，公件緊極，各啟朝者不忍違其葵誠，但必概從簡便，大小鄉紳並在任文武俱作一起，先見；舉貢生員百姓作一起，後見。俱止行一拜三叩頭禮，續到者免朝。
福州府知府熊經奉啟，恭請冕旒袞龍各式。諭司禮監察發龍袍袞服尺寸，速造；冕冠著照依「會典」。
令諭司禮監：『帝王御用，袍膳為先，內監乏員，輔官必備。隨駕承奉官鄧全著陞尚衣監右少監，管理冠袍帶履等事；奉御羅奇著陞尚膳監右少監，管理上用生熟膳羞等事務，兼理行宮雜事，併承旨傳外衙門知道』。
令諭司禮監：『今定行宮門外承旨傳事官四員：張鳳鳴、張玄度，該監再將隨行忠實可用之官再定二員。並接本官四員，盡與閒散官銜。吏部議啟，即日受事，勿誤』。
太常寺少卿臣曹學佺朝見，進啟一通。上目之曰：『此海內宿儒也！孤在唐國，聞名久矣。茲幸在此得見，以慰數十年景慕之意』。因賜坐、賜茶。
按學佺啟內三款：一為福建解京錢糧，俱宜屬兵餉項下，祈勿他用，恐防不繼；一為禮成之後，即宜遣靖虜伯鄭鴻逵抵關，相度防守進取事宜以聞；一禁戢逃兵沿途搶掠害民，似宜急諭逃將，令其識認部下之兵，收拾入伍，示以赦辜復用之意，暫紓民患。三者皆實著可行，故特隆眷顧云。
上傳禮部：初七日入城，監國。先祭告天地、太廟、唐國宗廟，俱用太牢，陳設簠簋籩豆如禮。仍擬恭代祭文三篇，攝禮部臣劉若金照會太常寺少卿署寺事臣曹學佺撰述。陳設俱遵旨行。
初六日，令諭布政司速造諸神牌位，設立太廟。令諭曰：『自古忠臣孝子未備居室，宗廟為先。今孤仰瞻孝陵，不勝憤痛。既議監國於茲，必先祭祖，方敢攝政。速於該省擇一公所，扁曰「行在太廟」，以備屆時行禮』。
謹按周易云：『享於帝立廟，萃渙之義也』。此舉關係不小。
初七日，駕入城，暫以南安伯府即舊督府為行宮，百官慶賀如禮。百姓焚香恭迎，歡聲載道。
特授貢生薛瑞泰司經局正字職銜。瑞泰字幼安，侯官人，熟於掌故，大中丞鳴宇公仲子也。知上稽古右文，以家藏御覽、玉海、太平廣記、資治通鑑各書計五百本有奇疏獻之，敕授此官。旋以年老不願仕進辭，溫旨答之云：『瑞泰以喬木世臣之家，敦禮義廉恥之節，在閩巍然如魯殿靈光。所進書籍，雅體孤心。如此京職，原敦勸，不准辭。仍候登極後，即行召對，全孤愛重老成之意』。後特簡頒詔書。於福寧州回，值兵餉不足，又捐助五百金，復進翰林院五經博士，亦異數也。
睿製縉紳、戎政、儒林三便覽序。戎政文曰：『孤惟人君能以至公待天下，方可責人臣以無私；苞苴不入司馬門，天子始得真將之用。真將得，六軍之命安矣。蓋文武，一剛柔也；剛柔，一動靜也。譬之身，文筋而武骨也、文背而武胸也。分則體用，合則一身。文蔑武、武蔑文，亦必不能獨立矣。孤故曰：文蔑武，為自蔑。蓋國家之治，必文武和於上，始民兵和於下。不然，立敗之道也。文之蔑武，而弊曰賄、曰凌。賄曰賢才也、凌曰節制也，皆大誤也，皆太祖所必誅也。抑文之節武，宜也，非過也。然必節以廉、制以禮。廉服其猛心，禮馭其悍氣也，自尋常之將言耳。若夫唐之郭、李，宋之岳、韓，我明之徐、常，今奉孤之兩鄭，皆大將也。將大不待節制，相大不妨專擅。不妨不待，皆能自師其心，此天地間之閒氣，必有為而生也。餘則必待節制而為用，令其心服，節制斯在；不然，激而決裂之，祖宗宗社危矣。目今劄弁滿天下，上失主權、下戕民生，奸臣之肉，其足食乎！孤真偽嚴而真是求；真大將，孤不難親拜而授鉞者。立見孝陵，復東南澤國，為半功；再復西北一統，報我烈廟深讎，為全功。半則以徐魏國報之，全則以郭汾陽酬之。王公豫待立功之全半，詔列甚明；惟我天下英雄，速圖自奮。戎政刻佈，文武吉甫，即副孤之切望，成孤中興之烈也』。縉紳文曰：『孤惟帝王之御世也，必本祖法而出治。治不獨出於帝王，必與文武之賢者共之。始於得賢將相，終於得賢百職。四海兆民，方有攸賴。民安，則華強彝服矣。然歷稽世道之汙隆，機握於帝王之宇量。宇量必包乎天下，始可以總統乎千官。千官當而民治，民大治而帝王安矣。帝王量狹，一統必割據；帝王量大，割據必一統。孤故曰：量，神物也，狹大之間，安危決矣，可不慎哉？量既容，始能用。彼聲色貨利，固帝王奔走天下之大用，而不可自溺所謂容也、量也。漢不能容，王終於霸；宋不能容，強終於弱。然必識在容中，如日月之行乎天上。不容則無天，日月何出乎？孤故曰：帝王量大，則識必高；識高，必用舍公明。又何有乎東林門戶、魏黨馬黨之紛紛哉？嗚呼！三黨成，遍安矣；四黨成，一隅矣！自今孝陵夷踐，孤心淚血千石。監國閩省，創設百司，約率眾而本己，官不備以惟人。焦勞昕夜，惟賢是求。臥薪而望孝陵，嘗膽以圖一統。真量真識，四方共鑒。蓋洪武廿四年分封唐國，祖訓命名，詩曰：「嘉歷協銘圖」，往時未詳，於今有悟。我天我祖，既預兆之，敢不孜孜敬天法祖，與我文武誓復舊疆，仰答我上帝之庥命乎？縉紳刻布，一哉王心；萬國臣民，願來協助。彝典酬功，信如皎日。語意神涵，天下亮之』。
命參將金錡齎捧監國赦款詔書，宣諭金、衢。
敕諭吏、兵二部，起大學士蔣德璟於泉州。敕曰：『今中興伊始，朕志切親征，密勿必得匡贊之臣，始可或從行、或分任居守燮理之重務。原任輔臣蔣德璟，簡重於先帝，久飫其經綸，況學博古今，度具忠亮，著以原官起用佐理。著新授行人張廷榜星速敦聘，即來行在，與朕分勞』云。德璟以足疾辭，復答云：『卿宏才偉度，海內具瞻。朕昔奉藩，聞之國儀方廣德尤悉。先帝簡任既至，朕實眷倚舊臣。南京之召未起，是卿進退節全。朕雖莫當明主，堅志自信，清我廟陵；焦勞徬徨，盼卿如渴。昨虛傳卿奉詔至，朕喜而不寐。隨諭侍臣，不必拘套，即著速至便殿召對。既而寂杳，朕心惘然！朕望卿之切如此，乃復往還，動淹旬月。辭奏一到，大恐朕心。足恙未痊，自有體裁之法。經濟名臣，堅不朕顧，朕誠薄德；還念高皇，定不准辭。十日之內，斷望卿到，慰朕至懷』！